SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

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SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection KitSARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

SARS-CoV-2 N501Y 突变检测试剂盒

试剂盒组成

供20次反应用

RT Enzyme Mix (20×)

RT 酶混合物(20x)

20 µL x 1支

One-Step Reaction Mix (2×)

一步反应混合物(2×)

200 μL x 2支

501N Wild type Primer/Probe (Probe:FAM)

501N 野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

N501Y Mutant Type   Primer/Probe (Probe:FAM)

N501Y 突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

10 µL x 1支

供200次反应用

RT Enzyme Mix (20×)

RT 酶混合物(20x)

200 µL x 1支

One-Step Reaction Mix (2×)

一步反应混合物(2×)

1 mL x 2支

501N Wild type Primer/Probe (Probe:FAM)

501N 野生型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

N501Y Mutant Type   Primer/Probe (Probe:FAM)

N501Y 突变型引物&探针混合物(探针:FAM)

100 µL x 1支

背景


新冠病毒突变株在世界范围内不断扩散,感染人数也在不断增多。如Alpha (B.1.1.7)、Beta (B.1.351) 和 Gamma (P.1) 突变株都有着N501位点的突变,与常规毒株相比,具有更强的感染性。

※ Alpha (B.1.1.7):英国最先检测出的突变株

       Beta (B.1.351):南非最先检测出的突变株

       Gamma (P.1):巴西最先检测出的突变株

通过FUJIFILM Wako研发的Primer技术,可以高灵敏度检测难以检测的基因点突变。本试剂盒可以快速、简便地检测N501Y突变。

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit                              SARS-CoV-2 N501Y突变检测试剂盒

特点

      判定容易

    使用突变株与常规株(无突变)的Primer/Probe (引物/探针)套装,通过比较Ct值进行判定

      使用一步法RT-qPCR,快速检测突变

    约70 min即可完成

      使用FUJIFILM Wako研发的Primer/Probe(引物/探针)套装,高灵敏度检测突变

      所有突变株可在相同反应条件下进行检测

     由于N501Y、E484K、L452R、E484Q的PCR反应条件相同,因此可在同一块96孔板中进行检测。

 


检测原理

采用TaqMan® 探针的One Step RT-qPCR法进行检测。

利用FUJIFILM Wako开发的Primer引物技术,高灵敏度检测点突变。

▼使用前

病毒RNA量较多时,在突变株中使用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”,也可以观察到扩增信号。

务必使用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”和突变株检测用的“N501Y Mutant Type Primer/Probe”两种试剂进行检测。

比较两种试剂的Ct值,若突变株检测用“N501Y Mutant Type Primer/Probe”的Ct值小,则可判断病毒为N501Y突变株。

突变株的检测应用数据

本试剂盒已检测出以下4种新冠病毒(SARS-CoV-2)株。

● Alpha (B.1.1.7)突变株(QHN001、N501Y突变,由国立感染症研究所提供)

● Beta (B.1.351)突变株(TY8-612、N501Y突变、E484K突变,由国立感染症研究所提供)

● Gamma (P.1)突变株(TY7-501、N501Y突变、E484K突变,由国立感染症研究所提供)

● VR-1986HK(N501Y无突变、E484K无突变 ATCC)

拷贝数:5000、500、50copies/Well 3种

循环数:45

 


  Alpha (B.1.1.7)突变株:QHN001(N501Y突变

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5,000 copies

500 copies

50 copies

Alpha型

(含N501Y突变)

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对于含有N501Y突变的alpha (B.1.1.7)突变株,利用突变株检测用“N501Y Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号。另外,在常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime&Probe”中未观察到扩增,由此判断为N501Y突变株。



②Beta (B.1.351)突变株:TY8-612(N501Y突变、E484K突变)

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5,000 copies

500 copies

50 copies

Beta型:TY8-612

(N501Y 突变,E484K 突变)

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常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime/Probe”,5,000 copies的条件下可观察到轻微的扩增信号,但突变株的可以在更低Ct值下检测到,由此判断为N501Y突变株。在复制500 copies和50 copies条件下,未检测到常规株(非突变)的扩增信号。

③Gamma (P.1)突变株:TY7-501(N501Y突变、E484K突变)


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5,000 copies

500 copies

50 copies

Gamma型

(N501Y 突变,E484K 突变)

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对于含有N501Y突变的巴西株突变株,利用突变株检测用的“N501Y Mutant type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号

常规株(突变)检测用的“501N Wild type Prime&Probe”,在复制5,000 copies的条件下可观察到扩增信号,但突变株的可以在更低Ct值下检测到,由此判断为N501Y突变株。在500 copies500copies的条件下,未能检测到常规株(非突变)的扩增信号。

④VR-1986HK(N501Y无突变、E484K无突变)

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5,000 copies

500 copies

50 copies

无突变

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对于不含N501Y突变和E484K突变的VR-1986HK利用常规株(非突变)检测用的“501N Wild type Primer/Probe”,可以确认到扩增信号。在突变株检测用的“N501Y Mutant type Prime/Probe”中未观察到扩增,由此判断为常规株的突变株。

PCR反应条件

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常规株以及突变株的基因型

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产品列表

产品编号

产品名称

包装

283-35703

SARS-CoV-2 N501Y Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N501Y 突变检测试剂盒

20次反应用

287-35701

供200次反应用

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供200次反应用

FAQ

Q:能否判定新冠病毒阳性/阴性?

A:本试剂盒检测阳性样品中是否存在基因突变,无法判定阳性/阴性。

Q:能否检测用直接PCR法简单提取的RNA样品?

A本试剂盒无法检测简单提取的RNA。请使用RNA提取/纯化试剂盒等生成的RNA。

      离心柱:ISOSPIN Viral RNA(产品编号: 310-08931, 日本基因)

      自动核酸提取仪:QuickGene-Auto 12S/24S(倉敷紡績,还需要QuickGene AutoS RNA Virus Kit)

Q:试剂盒包装“200 Reactions”是什么意思?

A:【200 Reactions】是指实时PCR可以分开200孔进行。1个样品需要2个孔,即100个样品。

 ①    含有常规株的Primer&Probe的孔

 ②    含有突变株的Primer&Probe的孔

Q:试剂盒中是否包含病毒的阳性对照RNA?

A:本试剂盒不含阳性对照。若有需要,请向FUJIFILM Wako客服咨询。

Q:当野生株和突变株的扩增曲线均起峰时,应如何判断?

A如果病毒量高,无论是突变株样品,还是野生株,都有可能在其Primer&Probe中观察到扩增信号。然而,在此情况下,突变株的扩增信号上升

      得更快(Ct值小)。请务必通过突变株和常规株用的两种Primer&Probe进行检测,以确定 Ct 值的差异。

Q:是否存在E484K单独突变?

A不含N501Y突变、但含E484K突变的E484K单独突变株,已被确认为R.1株。但目前的信息较少,日本国立传染病研究所认为它是需要关注的突

      株(VOI),而不是高关注突变株(VOC)。

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