NudC 焦磷酸酶 |NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品信息

NudC 是 NUDIX 焦磷酸酶家族中的一员，可高效水解 带 NAD+帽 和 NADH 帽的 RNA，生成连接可用的带 5′ 单磷酸末端的 RNA（NAD+ 脱帽或去除 NAD）（1）。研究表明，nudC 基因的缺失增加了 E. coli 中 NAD+ 帽化 RNA 的比例（2）。

NudC 还能以不同的效率水解含 ADP 基团的小分子，如 NADH、NAD+、AppA、ADP-核糖、ADP-葡萄糖和代谢辅因子，如 FAD、辅酶 A 和乙酰辅酶 A（3 和未发表结果）。由于其对各种二核苷酸和代谢辅因子的活性，NudC 有望通过对帽的焦磷酸化水解作用和核苷酸产物的分析，来识别带有非经典帽结构的 RNA；或使用基于 5’ 连接的方法（如 RNA 测序或 5’ RACE（4）），来识别带有 5´ 单磷酸末端的 RNA。

NudC 焦磷酸酶 | 

产品类别:
RNA Modification

  • 产品组分信息

    本产品提供以下试剂或组分：

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • M0607S     -20    
        NudC Pyrophosphatase M0607SVIAL -20 1 x 0.025 ml 10 µM
        NEBuffer™ r3.1 B6003SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
        Dithiothreitol (DTT) B1222AVIAL -20 1 x 0.5 ml 100 mM

  • 特性和用法

    单位定义

    在 1X NEBuffer 3.1 和 5 mM DTT 的反应条件中，加入 1 µM NudC，37℃温育 30 分钟，能将 200 µM 或更多 NAD+ 水解成 NMN+ 和 AMP。

    反应条件

    1X NEBuffer™ r3.1
    Supplement with 5 mM DTT
    Incubate at 37°C

    NEBuffer™ r3.1
    100 mM NaCl
    50 mM Tris-HCl
    10 mM MgCl2
    100 µg/ml Recombinant Albumin
    (pH 7.9 @ 25°C)

    贮存溶液

    300 mM NaCl
    10 mM Tris-HCl
    1 mM DTT
    0.1 mM EDTA
    50% Glycerol
    pH 7.9 @ 25°C

    热失活

    65°C for 10 minutes

  • 参考文献

    1. Frick D.N. and Bessman M.J. (1995).  J. Biol. Chem. 270, 1529-1534.
    2. Cahová, H. et al. (2015). Nature. 519, 374-377.
    3. Höfer K. et al. (2016). Nat Chem Biol. 12, 730-734.
    4. Vvedenskaya I.O., et al (2018). Mol Cell. 70, 553-564.e9.

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Protocol for using NudC in decapping RNA containing non-canonical initiating nucleotides (NEB #M0607)

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Does NudC (NEB #M0607) decap other cap structures?
    2. Does NudC decap canonical G-capped RNA?
    3. Is it possible to use NudC to generate ligatible 5′ monophosphate RNA from non-canonical initiating nucleotides only?
    4. Is NudC decapping activity affected by the structure of the RNA?
    5. What are Enzymes for Innovation?
    6. Can you tell me more about the switch from BSA to Recombinant Albumin (rAlbumin) in NEBuffers?