Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品信息

Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |

NEBNext® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒包含用于 Illumina 测序的链特异性 RNA 文库制备的试剂。请注意，接头、引物、rRNA 去除试剂和 poly(A) mRNA 分离试剂未随试剂盒提供，须单独购买。

试剂盒内每个组份都通过严格的质量监控，每套试剂都经过文库制备，并通过 Illumina 测序平台测序验证。

Ultra RNA 链特异性文库制备Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |

NEBNext Ultra™ RNA 链特异性试剂盒可产生具有高定向性/链特异性的文库Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |
使用纯化的通用人参考 RNA（Agilent® #740000）制备 的 Ultra RNA 链特异性文库在 Illumina 平台上进行测序。与预期链匹配的 read 百分比越高，文库的链特异性越高。需要使用放线菌素 D 才能实现最大链特异性。

NEBNext Ultra™ 链特异性 RNA 文库展现了转录本的均一覆盖度Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |
mRNA 分离自通用人参考 RNA（Agilent #740000），并使用 NEBNext Ultra™ 链特异性 RNA 试剂盒和 Illumina TruSeq Stranded mRNA 试剂盒制备文库。文库在 Illumina 平台（GAIIx）上测序（单端 read）。整个表达转录本都展现了良好覆盖度。

低起始量 NEBNext Ultra 链特异性 RNA 文库保留了复杂性Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |
使用 NEBNext Ultra 链特异性 RNA 试剂盒，从 10 ng 或 100 ng 通用人参考 RNA（Agilent #740000）制备去除核糖体 RNA 的 RNA 文库。每 Kb、每百万匹配的外显子片段的转录本丰度（FPKM）显示出很强的一致性（R2 = 0.90745），这说明即使在低起始量的情况下，文库的复杂性仍得以保留。

使用NEBNext Ultra 链特异性 RNA 文库进行技术性重复实验，表现出转录本间的一致性Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |
使用分离自通用人参考 RNA（Agilent #740000）的 mRNA 制备文库，对此文库进行技术性重复实验，结果显示出很强的一致性（R2 = 0.99409）。

测序数据表明，NEBNext Ultra 链特异性 RNA 和 Illumina TruSeq 链特异性 RNA 文库之间具有很强的一致性Next® Ultra™ RNA 链特异性文库制备试剂盒 |
mRNA 分离自通用人参考 RNA（Agilent #740000），使用 NEBNext Ultra 链特异性 RNA 试剂盒和 Illumina TruSeq Stranded mRNA 试剂盒制备文库。FPKM 一致性图显示了文库之间具有相似的转录本表达（R2 = 0.96009）。

批次质控

所提供的单独批次均通过额外功能验证。单个试剂通过标准酶活性和质控分析，并同时满足各单独组分页面列出的严格的附加质控标准

产品类别:
Discontinued (<3 years)

  • 特性和用法

    需要但不提供的材料

    • NEBNext Poly(A) mRNA 磁性分离模块（NEB #E7490）或 NEBNext rRNA 去除试剂盒（NEB #E6310）
    • NEBNext 单样本（NEB #E7350）或 NEBNext 多样本（NEB #E7335、#E7500、#E7710、#E7730、#E6609、#E7600）接头引物试剂盒或用户自备接头引物
    • 磁力架或磁力板（例如：NEBNext® 磁性分离架，NEB #S1515S；Alpaqua ® 96S 超磁性分离板，#A001322；或同等器材）
    • 80% 乙醇（新鲜配制）
    • 0.1X TE，pH 8.0
    • 10 mM Tris-HCl、pH 7.5 – 8.0
    • 10 mM NaCl（可选）
    • Agencourt® AMPure® XP Beads（Beckman Coulter, Inc. #A63881）
    • 放线菌素 D（Sigma #A1410，在二甲基亚砜 [DMSO] 中溶解至 5 μg/ul）
    • 用于 NEBNext rRNA 去除试剂盒（NEB #E6310）的其它需要但不提供的材料：Agencourt RNAClean® XP（Beckman Coulter, Inc., Cat #A63987）

  • 优势和特性

    Features

    • 准确保留转录本链来源信息
    • 使用基于 dUTP 的方法
    • 低起始量（低至 10 ng 纯化 mRNA 或去除核糖体 RNA，或 100 ng 总 RNA）
    • 实验流程快速（4.5 – 5 小时），可最大限度减少手动操作时间
    • 性能稳定、可靠
    • 超高保真度扩增，可将 GC 偏嗜性降至最低

  • 相关产品

    相关产品

    • e6310-nebnext-rrna-depletion-kit-human-mouse-rat

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Protocol for use with NEBNext Poly(A) mRNA Magnetic Isolation Module (E7490) and NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (E7420)
    2. Protocol for use with NEBNext rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) (E6310) and NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina(E7420)
    3. Protocol for use with Purified mRNA or Ribosome Depleted RNA  – NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (E7420)

  • 说明书

    产品说明书包含产品使用的详细信息、产品配方和质控分析。

    • manualE7420

  • 使用指南

    • Getting Started with RNA-Sequencing (RNA-Seq)

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Is the Monarch Total RNA Miniprep Kit compatible with NEBNext reagents for RNA Library Prep?
    2. What is the difference between the NEBNext Ultra Directional RNA library prep kit for Illumina (E7420) and the NEBNext Ultra RNA library prep kit for Illumina (E7530)?
    3. What is the starting material I need to use when preparing libraries using the NEBNext Ultra Directional RNA kit?
    4. Which kit can I use to isolate Poly (A) mRNA from Total RNA?
    5. Does the kit provide adaptor and primers?
    6. How do I know the concentration of my index primers? 
    7. I have USER® Enzyme from my NEBNext® library prep kit (blue cap) and USER Enzyme from my NEBNext Index Primer kit (red cap). Are they the same?
    8. Which NEBNext Oligos can be used with this library prep kit?
    9. Can I use this NEBNext kit with adaptors and primers from other vendors than NEB?

  • 问题解决指南

    • NEBNext® RNA Library Prep Kit Troubleshooting Guide (NEB #E7760, E7765, E7770, E7775, E7420, E7530)