FDA认证化合物库包含的640种化合物全都是经FDA认证且已经用于临床治疗，可大大加速药物开发和优化。该化合物库中不包括一些无关的或者未知生物活性的化合物，比如：如除草剂，杀虫剂，防晒剂，细胞毒性药物。本库拥有最为丰富的化合物，并最大程度提供药物相似度，药物研发的最好开端。